有益なバクテリアとは、根圏または栽培培地に導入されると、植物の健康、栄養素の利用可能性、および病気への抵抗力を積極的に改善する微生物です。水耕栽培で最もよく研究されている属には、バチルス・サブチリス（ピシウムやその他の根の病原菌を抑制）、トリコデルマ（根にコロニーを形成し、有害な菌類を凌駕する有益な菌類）、および菌根菌（根の栄養素吸収表面積を劇的に拡大する共生ネットワークを形成する）が含まれます。
主なポイント
- Bacillus subtilis: produces antifungal compounds that suppress Pythium root rot
- Trichoderma: colonises root surfaces and outcompetes harmful pathogens for space and nutrients
- Mycorrhizae: form symbiotic networks extending effective root surface area up to 1000×
- Beneficial microbes are incompatible with hydrogen peroxide, bleach, and strong oxidising treatments
- Most effective in media-based systems (coco, rockwool, perlite) — harder to maintain in DWC
- Products: Great White, Tarantula, Hydroguard (Bacillus amyloliquefaciens) — apply at transplant